Adattato dai primi tre libri della serie per bambini in 14 volumi I Guardiani di Ga'Hoole scritti da Kathryn Lasky e illustrati da Richard Cowdry, il film è stato sviluppato con gli artisti della Animal Logic e viene descritto dai produttori come una specie di Harry Potter. La storia segue le vicende di un piccolo barbagianni di nome Soren, da sempre suggestionato dalle storie epiche dei Guardiani di Ga'Hoole che gli racconta suo padre. Il mitico gruppo di guerrieri alati aveva combattuto una grande battaglia per salvare tutti i gufi dai terribili Puri. Mentre Soren sogna di entrare a far parte, un giorno, di questo gruppo di eroi, il suo fratello maggiore Kludd ambisce solo a volare, cacciare e diventare il preferito del padre. La gelosia di Kludd porta con sè terribili conseguenze - entrambi i barbagianni finiranno per perdersi e finire giusto nelle grinfie dei Puri, che li rapiscono e iniziano ad allevarli come guerrieri nell'Accademia di St. Aegolius per Gufi Orfani. Soren elabora così un piano di fuga assieme ad altri piccoli gufi: insieme attraverseranno il mare e la nebbia per trovare il Grande Albero, la casa dei leggendari Guardiani di Ga'Hoole - l'unica speranza di Soren per sconfiggere definitivamente i Puri...